La Contaminazione è dovuta alla formazione di impurità nella cella fotovoltaica a causa di elementi estranei nella delicata fase di drogaggio del wafer di silicio. Si verifica specialmente nelle celle multicristalline che derivano dalla fusione e successiva ricristallizzazione del cosiddetto ‘’scraps’’ ossia il silicio di scarto.
La contaminazione è un difetto presente dalla nascita del modulo e sembra non peggiorare la produttività del modulo, tuttavia può contribuire al declassamento del modulo ad una potenza inferiore.